1. 基因突变的有害性和有利性
大多数基因的突变，对生物的生长与发育往往是有害的。可能会导致基因原有功能丧失；基因间及相关代谢过程的协调关系被破坏；性状变异、个体发育异常，生存竞争与生殖能力下降，甚至死亡――致死突变。突变的有害和有利性是相对的，在某些情况下，基因突变的有害与与有利性可以转化。如抗逆性突变是有利的，又如作物矮杆突变型在多风与高肥环境下是有利的。
2.基因突变的普遍性和稀有性
基因突变在生物界具有普遍性，无论是低等生物还是高等生物，都有可能发生基因突变。包括自然突变和人工诱变突变。但是在自然状态下，突变也是极为稀有的，野生型基因以极低的突变率发生突变。
3. 基因突变的随机性和不定向性
（1）基因突变的随机性
①部位上的随机。基因突变既可以发生在体细胞中，也可以发生在生殖细胞中，且前者一般不会传递给后代，而后者可通过生殖细胞传递给子代。此外基因突变既可以发生在同一dna分子的不同部分，也可以发生在细胞内不同的dna分子上。
②时间上的随机，基因突变可以发生在生物个体发育的任何阶段，甚至在趋于衰老的个体中也容易发生，如老年人易得皮肤癌等。
（2）基因突变的不定向性
基因突变的不定向性指基因突变可以多方向发生，即基因内部多个突变部位分别改变后会产生多种等位基因形式。
4.基因突变的重复性和可逆性
（1）基因突变的重复性是指已经发生突变的基因，在某种条件下，还可能再次独立地发生突变而形成其另外一种新的等位基因形式。也就是说，任何一个基因位点的突变可能会以一定的频率反复发生。
（2）基因突变的可逆性，基因突变的发生方向是可逆的。
5.基因突变的平行性
指亲缘关系相近的物种因为遗传基础比较接近，往往会发生相似的基因突变。
1、物理因素：伽马射线、紫外线等。
2、化学因素：碱基类似物、黄曲霉素等。
3、生物因素：某些病毒和细菌等。
4、基因内部的脱氧核苷酸的数量、顺序、种类发生了局部改变从而改变了遗传信息。
可以将突变技术应用于dna缺失改造、蛋白质工程和酶等多个研究领域，促进人类社会的发展。
